Les déplacements des migrateurs amphihalins sont observés au niveau des barrages. Des systèmes de comptage sont installés afin de suivre les flux de migration. Il s'agit de stations de contrôle des migrateurs: on en compte 14 en Bretagne. Elles permettent d'estimer les quantités de migrateurs en montaison et en dévalaison sur 10 bassins versants.

Localisation des 14 stations de contrôle des migrations en Bretagne(Source : BGM, 2023)

En comparaison du vidéo comptage, les systèmes de piégeage permettent d'obtenir 2 types d'informations supplémentaires :

• Informations individuelles sur les Salmonidés dans le cadre de suivis scientifiques particuliers
• Détermination des espèces possible : distinction alose feinte / grande alose et lamproie marine / lamproie fluviatile
• Une meilleure précision de la mesure de la taille. Selon l'étalonnage de la vidéo et les contraintes techniques (taille de la vitre, espace entre la vitre et la caméra, etc.), la taille des poissons observés en vidéo-comptage peut en effet être moins précise.

En revanche, le piégeage demande plus de main d'œuvre. Ces 2 méthodes de suivi des flux de migrations sont donc utilisées dans des objectifs différents.

De nombreux suivis des populations peuvent être réalisés grâce à ces données. Ils permettent non seulement de mieux connaître les espèces, mais aussi de suivre leur évolution : quantité de géniteurs, quantité de jeunes, périodes de migration, taille des individus, proportion de poissons issus d'élevage... Autant d'informations qui serviront ensuite pour prendre les mesures nécessaires à leur sauvegarde.

Accéder aux suivis des migrations aux stations de vidéocomptage

Accéder aux suivis du recrutement fluvial aux passes-pièges à anguille

Les pêches d'indice d'abondance sont réalisées aux mêmes endroits chaque année. Ce qui permet des comparaisons inter annuelles de la reproduction. Les secteurs échantillonnés sont les zones courantes bien oxygénées des têtes de bassin versant. Ces habitats aquatiques de faciès courant ont été décrits comme les milieux recherchés par les géniteurs pour l'aménagement de leurs frayères car ils assurent une survie optimale des œufs et constituent les habitats propices à la croissance des jeunes.

Des études ont permis d'établir une relation entre la surface d'eau courante et la quantité de tacons qui l'occupe. Les saumons étant territoriaux dès leur émergence de la frayère, ils ont besoin d'une surface minimale pour leur croissance. La densité est évaluée à 48 tacons de moins d'un an pour 100m² de zone courante (radier-rapide) (donnée du Scorff entre 1975 et 1983, dans Prévost & Baglinière, 1993). 

Les surfaces potentielles ont été cartographiées à l'échelle de la Bretagne selon un protocole standardisé. Elles sont exprimées en m² par bassin versant. Elles correspondent à la somme des surfaces de radiers, de rapides et de 1/5 de la surface des plats (Porcher & Prévost, 1996).

L'utilisation d'un matériel portatif de pêche électrique présente plusieurs avantages :

• un coût moindre (en comparaison du matériel de pêche à l'électricité nécessitant un groupe électrogène et des câbles électriques déroulés parfois sur de grandes distances, augmentant par ailleurs le risque d'accident),
• un accès facilité dans des endroits encombrés,
• un nombre limité d'opérateurs,
• une bonne efficacité sur les salmonidés,
• un risque faible de mortalité sur les poissons.

Le protocole utilisé en Bretagne par les FDAAPPMA est le même que celui qu'utilise l'INRA dans le cadre de ses différents suivis des populations de saumon en France. Il s'agit de la méthode des indices d'abondance de saumon (E. Prévost & J.L. Baglinière, 1993). Elle est utilisée chaque année pour évaluer l'abondance des tacons dans les cours d'eau bretons et fournit des informations sur la réussite annuelle de la reproduction sur les bassins versants colonisés par le saumon atlantique.

Le suivi de la reproduction annuelle du saumon atlantique a débuté en 1997 en Bretagne. 7 bassins étaient intialement échantillonnés selon cette méthode. Depuis 2012, 23 bassins versants sont suivis avec ce protocole en Bretagne, soit plus de 250 stations échantillonnées chaque année.

Localisation des stations d'indices d'abondance Saumon en Bretagne (Source : BGM, 2021)

Chaque station fait l'objet d'un échantillonnage de la population de jeunes saumons par une méthode standardisée identique depuis le début du suivi. Cet ensemble de prospections constitue un réseau d'échantillonnage de juvéniles de saumons. Les courbes d'évolution interannuelle des effectifs de juvéniles ainsi obtenues permettent de caractériser la reproduction annuelle.

La production de juvéniles de saumons de chaque bassin versant est ensuite évaluée grâce à la cartographie des habitats favorables à leur croissance. Cette cartographie fournit en effet la surface accessible des habitats favorables à la croissance des jeunes. Des calculs sont réalisés par la suite en fonction des taux de survie en eau douce et en mer afin de fixer le nombre maximal de géniteurs de saumons prélevable par les pêcheurs sur chaque bassin versant. Ceci permet en outre d'évaluer la contribution de chaque bassin versant dans la production de saumons en Bretagne.

Accéder à l'estimation des zones favorables à la croissance des juvéniles de saumons

Télécharger la présentation et les premiers éléments de mise au point d'une méthode simple d'évaluation du recrutement en juvéniles de saumon atlantique de l'année en eau courante (Prévost & Baglinière, 1993)

Télécharger le protocole des indices d'abondance de juvéniles de saumons

Télécharger la présentation sur les suivis réalisés dans le Finistère pour le saumon atlantique : les indices d'abondance de juvéniles de saumon (Colloque "Quel avenir pour nos poissons migrateurs ?", N. Bourré, 2012)

Lire l'actualité (septembre 2016) Le suivi des populations de saumons sur les cours d'eau bretons

Télécharger la bibliographie sur le saumon atlantique (D. Le Brech, FDPPMA 35, 2009)Suivi par pêche électrique de la population de saumon atlantique

Le stade anguille jaune, le plus long stade de la vie de l'anguille, constitue le stock en milieu continental. En effet, les juvéniles (larves et civelles) et les géniteurs sont des phases migrantes tandis que l'anguille se sédentarise plusieurs années avant sa maturité sexuelle. On ne connaît pas la part d'anguilles qui choisissent de s'établir en milieu marin (estuaire et littoral). Il n'est donc pas aisé d'évaluer le stock réel d'anguilles sédentaires. En revanche, pour celles qui vivent en eau douce, plusieurs suivis sont réalisés. Ces suivis fournissent des renseignements sur :

• Les quantités d'anguilles dans les cours d'eau : présence / absence, évolution des densités (nombre d'individus/m²),
• La composition par tranche d'âge : population jeune ou vieillissante,
• La localisation du front de colonisation : point de blocage de la migration des jeunes vers l'amont, situé essentiellement au niveau des barrages,
• L'état de santé des individus : révélé par la taille, le poids et l'état sanitaire des individus

Les anguilles jaunes constituent un stock composé d'individus de tous âges. Parmi les anguilles jaunes, on distingue des jeunes individus en phase de colonisation des eaux douces, des individus sédentarisés en phase de grossissement et des individus qui se métamorphosent pour leur retour en mer. La pêche à l'électricité est le moyen utilisé pour suivre l'état du stock.

Plusieurs méthodes permettent d'analyser la population d'anguilles qui vivent dans les cours d'eau. Dans tous les cas, il s'agit de pêches à l'électricité, moyen utilisé en eau douce pour échantillonner les peuplements de poissons. Cette méthode d'échantillonnage, bien qu'étant la moins nocive et la moins traumatisante pour les poissons est toutefois à utiliser avec modération et avec beaucoup de précautions que ce soit pour les manipulateurs et pour les poissons. Rappelons également que les poissons capturés à l'aide de pêches électriques sont manipulés avec beaucoup de soin et remis à l'eau vivants. 3 protocoles de pêches électriques permettent d'évaluer l'abondance des anguilles en eau douce :

• des pêches d'indices d'abondance sur les quatre départements bretons et la Loire Atlantique (pratiquées par les FDPPMA),
• des pêches par habitat sur le bassin de la Vilaine (pratiquées par l'EPTB Vilaine),
• des pêches par faciès d'écoulement (lotique ou lentique) en plusieurs passages sur le bassin du Frémur (pratiquées par FishPass).

Ces deux dernières méthodes permettent de calculer des densités d'anguilles (nombre d'individus par unité de surface en eau). Répétées régulièrement au même endroit, elles constituent des chronologies permettant de suivre l'évolution de l'espèce.

Les pêches électriques permettent d'obtenir des informations précieuses sur l'évolution d'une population et sur son état de santé :

• Les densités : Les effectifs d'anguilles dénombrées lors des pêches à l'électricité sont transformés en densités par unité de surface. Ces densités représentent l'information principale sur l'état du stock.
• La composition de la population : Lorsque l'on souhaite connaître l'état d'une population, on étudie l'état des individus et notamment leur âge et leur état de santé. Une population équilibrée est composée de plusieurs classes d'âge avec une plus forte proportion de jeunes individus. Par ailleurs, la proportion d'individus présentant des pathologies ne doit pas être trop élevé au risque de mettre en péril le renouvellement des générations.
• La structure d'âge : Les anguilles capturées lors des pêches à l'électricité sont toutes mesurées. La composition en tailles d'une population informe sur son devenir. En effet, une population composée uniquement d'anguilles de plus de 45 cm mettrait en évidence un déséquilibre de la pyramide des âges. Cette population serait vieillissante et amenée à disparaître si aucun jeune ne leur succédait.
• Le poids n'est pas mesuré systématiquement lors des suivis. Les anguilles sont pesées dans le cadre d'études spécifiques où elles sont marquées individuellement. Dans ce cas, il est possible d'établir des courbes de croissance. La croissance varie selon les milieux ; elle peut atteindre 6-8cm par an dans des conditions optimales. Le plus souvent, elle est de l'ordre de 5,5 cm/an.
• Le front de colonisation : Il s'agit de l'endroit le plus amont d'un cours d'eau où sont présentes les jeunes anguilles. La localisation de cet endroit fournit des informations sur la fluidité de la migration d'aval en amont.
• L'état de santé : La santé des anguilles jaune est déterminante pour la survie à tous les stades et en particulier au stade des anguilles argentées car celles-ci doivent affronter des conditions de vie extrêmes en mer (pression, jeûne, température...).

Les premières pêches d'indices d'abondance ont eu lieu en 2002 sur le bassin de l'Aulne. Elles étaient organisées par l'Université de Rennes 1 et ont permis d'affiner le protocole d'échantillonnage. Aujourd'hui, plus de 670 stations ont été échantillonnées et près de 280 réactualisées sur une vingtaine de bassins versants.

Indices d'abondance en Bretagne entre 2007 et 2021 (BGM, 2021)

Sur le bassin versant de la Vilaine, certaines stations sont suivies depuis 1998 par l'IAV. Sur 46 stations de pêche électrique prospectées sur ce bassin chaque année de 1998 à 2005 (BRIAND et al., 2006), une sélection de 19 stations situées sur 10 affluents ont été conservées à partir de 2007 et sont depuis prospectées tous les 1 à 2 ans (Gestion de l'anguille sur le bassin de la Vilaine en 2021 : Suivi du recrutement fluvial sur les 2 passes-pièges et du stock en place par pêche électrique (Briand et al., 2022).

Un suivi de l'évolution des populations d'anguilles sur des bassins ayant déjà fait l'objet d'un état des lieux a été mis en place avec un retour tous les 3 à 5 ans. L'objectif est d'évaluer les actions de restauration de la continuité écologique et de suivre le front de colonisation de l'anguille. Le réseau est composé de 45 à 60 stations par département soit 15 échantillonnées chaque année. Ce suivi complète les suivis réalisés sur les bassins versants du Frémur et de la Vilaine.

En parallèle depuis 2013, un réseau de suivi du recrutement fluvial, dont l'objectif est d'évaluer le recrutement en jeunes anguilles, est échantillonné chaque année.