La truite fario est classée en préoccuption mineure depuis 2010 à l’échelle mondiale selon les critères de l'Union Internationale pour la Conservation de la Nature (UICN).
Classement UICN de la trutie fario à l'échelle mondiale
Au niveau de la Bretagne, elle est classée quasi-menacée nepuis 2024 alors qu’elle était en préoccupation mineure en 2015. Ce classement se justifie par une tendance significative à la baisse de ses effectifs dans les dix dernières années.
Tendance temporelle des indicateurs démographiques pour la truite fario, (densité surfacique en ind./m², taux d’occurrence sur stations réseau OFB, pourcentage de juvéniles). La ligne rouge matérialise la période d’évaluation
(Bouchet L., 2024.Dynamique de population des poissons d’eau douce de Bretagne : contribution à l’actualisation de la Liste Rouge Régionale. Rapport de stage Université de la Rochelle, OFB. 63 pages)
La truite se reproduit sur des zones courantes peu profondes à granulométrie grossière qui se situent dans des petits cours d’eau de « têtes de bassins versants ». Cette espèce est un bon indicateur du fonctionnement des cours d’eau salmonicoles et plus particulièrement des têtes de bassin. La truite constitue une espèce parapluie de ces dernières zones, qui sont colonisées par une communauté de petites espèces : chabot, vairon, lamproie de Planer…
Les aménagements hydrauliques et la mise en culture des bassins versants depuis les années 1970-1980 ont eu un impact fort sur l’habitat et les conditions de reproduction de la truite. Le colmatage des frayères lié à l’érosion des bassins versants (mise en culture, drainage, remembrement) affecte la survie des œufs et des alevins. De plus, de nombreux obstacles (buses, seuils, étangs …) entravent les migrations de reproduction vitales pour cette espèce.
Le dérèglement climatique tend à réchauffer les eaux mais également à accentuer les phénomènes hydrologiques (crues, étiages). Ces modifications particulièrement marquées à l’Est de la région sont très préjudiciables à cette espèce sténotherme d’eaux froides. En effet, les étiages y sont plus sévères, les températures plus élevées et les têtes de bassins ont été fortement touchées par les travaux hydrauliques, les créations d’étangs et l’érosion des bassins versants. En Bretagne-Est, la truite est en limite thermique de répartition et son habitat est très fractionné. Elle est donc particulièrement menacée.
En Bretagne, les truites de mer sont peu abondantes mais fréquentent l'ensemble des cours d'eau. Leur présence est plus marquée dans les fleuves de la façade de la Manche, de l'Aulne jusqu'au Couesnon. L’abondance des truites de mer est néanmoins peu connue dans les rivières bretonnes mais, est très faible comparativement aux cours d'eau normands : la truite de mer est peu représentée en Bretagne comparée à la Normandie en raison de différences dans les ressources trophiques liées au milieu marin (Quéméré E., Baglinière J.L., Roussel J.M., Evanno G., Mcginnity P., Launey S. (2015). Seascape and its effect on migratory life-history strategy influences gene flow among coastal brown trout (Salmo trutta) populations in the English Channel. Journal of Biogeography. 43. n/a-n/a. 10.1111/jbi.12632.).
L’abondance des remontées de truites de mer est très contrastée selon les stations de comptage, passant d’une situation très bonne sur l’Elorn à une situation très mauvaise sur la Vilaine. Les tendances des dernières années sont à la hausse notamment sur la rivière de l’Elorn.
La fragmentation des habitats a pour effet une baisse de l'abondance et de la variabilité génétique. Les ouvrages infranchissables limitent l'accès aux zones de reproduction. Lorsque les obstacles sont franchissables, leur multiplicité le long de l'axe migratoire induit :
- un retard allant jusqu'à compromettre la reproduction
- une baisse de l'itéroparité en raison d'une survie plus faible des poissons
- une sur-maturation des femelles avant la reproduction allant jusqu'à la mort des œufs ou la malformation d'embryons
- une réversibilité possible du stade smolt - truite de mer
