Estuaires : carrefours de migration des poissons migrateurs ! Article 2 : Pourquoi l'estuaire est-il vital pour les poissons ?
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Bretagne Grands Migrateurs lance en 2026 une nouvelle chronique "Estuaires : carrefours de migration des poissons migrateurs". Aujourd'hui, le deuxième épisode...
Lieu de rencontre des eaux douces et salées, les estuaires offrent une mosaïque d’habitats diversifiés indispensables à l’accomplissement du cycle de vie de nombreuses espèces piscicoles. Certaines y effectuent l’ensemble de leur cycle vital ; d’autres s’y nourrissent ou n’y font que passer…
Dans un estuaire, le nombre d’espèces piscicoles est généralement plus élevé en amont et en aval. En revanche en un point donné, la richesse spécifique est faible en raison de contraintes physico-chimiques fortes (salinité, température, turbidité, oxygène, …). Ceci étant, sur l’ensemble de l’estuaire, l’hétérogénéité des paramètres environnementaux permettent le maintien d’une diversité taxonomique et fonctionnelle élevée. 
Modèle conceptuel proposé pour les changements de biodiversité (espèces) estuarienne couvrant le continuum de salinité de l'eau douce à l'état hyperhalin (d'après Whitfield et al., 2012).
Des espèces de toutes origines
La majorité des espèces sont marines ou fluviales et viennent dans l’estuaire généralement pour se nourrir. Le gradient de salinité représente une zone de stress osmotique pour les organismes. Ce gradient conditionne la présence et la répartition des espèces au sein des estuaires. Il existe plusieurs guildes écologiques pour lesquelles l’estuaire remplit différentes fonctions :
- Les espèces fluviatiles
Elles ne tolèrent pas ou peu la salinité dans l’eau, par conséquent, leur présence se limite généralement à l’amont de l’estuaire (salinité inférieure à 0,5 voire 5 pour les plus tolérantes). Ces poissons descendent dans l'estuaire pour se nourrir. Exemples : Brèmes, gardons, sandres
- Les espèces résidentes estuariennes
Ce sont des espèces tolérantes à de larges gammes de conditions et qui ne se trouvent pas dans d'autres types de milieux. Certaines y accomplissent leur cycle de vie complet ; circulent également en eau douce ou en milieu marin. Exemples : Gobies tachetés, épinoches
- Les espèces marines
Ces taxons dominent les estuaires, tant en termes de biomasse totale que d'utilisation des zones littorales comme habitats de nurserie où les juvéniles y trouvent notamment des ressources trophiques abondantes nécessaires à leur croissance. Exemples : Soles, bars
- Les espèces amphihalines
Elles regroupent les espèces migratrices qui circulent entre le milieu marin et les eaux douces pour réaliser l’ensemble de leur cycle biologique. Certains taxons utilisent les estuaires comme zones de grossissement notamment au stade juvénile. Exemples : anguilles, mulets, flets, aloses, saumons…

Représentation des guildes écologiques présentes en estuaire (© GIP Loire Estuaire)
Le rôle majeur des estuaires pour les poissons migrateurs
Les poissons migrateurs ne fréquentent généralement les estuaires que pendant des périodes relativement brèves, lors de leur traversée par les juvéniles ou les adultes pour réaliser leur cycle de vie. Malgré tout, les estuaires sont généralement essentiels à la survie globale de ces espèces et, par conséquent, un transit sans obstacle à travers le continuum fluvial-estuarien-marin est crucial pour le maintien de la structure et du fonctionnement de ces taxons.
Autre particularité des estuaires, ils remplissent une fonction écologique cruciale pour certaines espèces, en particulier le mulet, le flet et l’anguille : celle de nourricerie et de croissance. Les estuaires sont des zones très productives, riches en matière organique. Le zooplancton et la faune benthique y trouvent donc les éléments nécessaires pour s’y développer en abondance. Ces organismes constituent ainsi une ressource alimentaire disponible pour les poissons. À ces ressources alimentaires disponibles s’ajoute la température de l’eau, plus chaude dans l’estuaire qu’en mer en période estivale, qui favorise la croissance des juvéniles. Enfin, la faible profondeur d’eau sur les secteurs de vasières en fait un refuge contre les prédateurs, ces zones leur étant plus difficilement accessibles.
Passage obligé pour les poissons migrateurs, la traversée ou le séjour des migrateurs dans l'estuaire constitue une étape obligatoire mais potentiellement difficile selon les obstacles rencontrés (barrages infranchissables, zones de déficit en oxygène, pollution trop importante, …). L’abondance et la diversité des espèces et des guildes écologiques sont dans tous les cas un gage de bon fonctionnement et de bonne santé écologique du milieu.
Sources :
- Groupement d’Intérêt Public (GIP) Loire Estuaire « Les poissons dans l’estuaire de la Loire », 2023 – 24p
- https://www.inrae.fr/actualites/estuaires-ecosystemes-pression#:~:text=Les%20estuaires%20abritent%20une%20variété,la%20biodiversité%20présente%20est%20particulière.
- https://ofb.gouv.fr/comprendre-les-milieux-estuariens-pour-mieux-les-preserver
- Teichert N., Lizé A., Virag L.-S., Tabouret H., Lamoureux J. Projet CRIJEST : Connectivité, cRoissance et Installation des Juvéniles de poissons dans les nourriceries ESTuariennes - Rapport final. Muséum national d’Histoire naturelle; Station marine de Dinard; Office français de la biodiversité. 2024, 130 p. ffhal-04803899
- Whitfield A.K., Elliott M., Basset A., Blaber S.J.M., West R.J. Paradigms in estuarine ecology – A review of the Remane diagram with a suggested revised model for estuaries, Estuarine, Coastal and Shelf Science, Volume 97, 2012, Pages 78-90, ISSN 0272-7714,https://doi.org/10.1016/j.ecss.2011.11.026.
Rendez-vous le mois prochain pour un nouvel épisode !

